Od roku 2009 Szkoła prowadzona jest przez Ministra Rolnictwa i Rozwoju Wsi.

Szkoła podlega bezpośrednio pod Departament Oświaty Rolniczej, który realizuje zadania Ministra Rolnictwa i Rozwoju Wsi dotyczące zabezpieczenia społecznego rolników, aktywizacji społecznej i zawodowej mieszkańców wsi, rozwoju przedsiębiorczości, rynku pracy, bezpieczeństwa i higieny pracy, oświaty rolniczej, ochrony dziedzictwa kulturowego wsi, a także współpracy ze związkami zawodowymi, organizacjami społeczno-zawodowymi rolników oraz samorządem rolniczym.

Tematyką szkół rolniczych zajmują się w szczególności:
Wydział Edukacji Rolniczej i Organizacji Szkolnictwa, Wydział Nadzoru Pedagogicznego, Wydział Planowania Budżetów i Finansów,Wydział Wdrażania Funduszy i Promocji Szkół.